醫(yī)學信息工程專業(yè)的就業(yè)前景很好，畢業(yè)生可到醫(yī)療衛(wèi)生部門、醫(yī)療器械設計與生產(chǎn)部門及其他企事業(yè)單位從事各類信息系統(tǒng)和計算機軟件系統(tǒng)的應用、設計、開發(fā)、維護和評測等工作；也可在醫(yī)藥研究機構、醫(yī)藥高等院校從事科學研究和教學工作。畢業(yè)生主要面向電子信息和醫(yī)學信息類的科研院所、醫(yī)藥衛(wèi)生單位、生物醫(yī)學電子信息企業(yè)等，從事科研、開發(fā)、應用設計制造及設備管理和銷售等方面工作，亦可從事生物醫(yī)學信息工程、醫(yī)學儀器設備研發(fā)的高新技術企業(yè)，以及其它電子、計算機、信息、生物等領域的高新技術企業(yè)、高等院校、科研單位、商檢等部門。此外，還可以在政府醫(yī)藥衛(wèi)生部門，各級各類醫(yī)療機構、社會醫(yī)藥相關事業(yè)機構、醫(yī)藥軟件開發(fā)企業(yè)、研究機構、醫(yī)藥企業(yè)等部門求職。