民航局直屬高校共有4所，分別為中國民航大學(xué)、中國民用航空飛行學(xué)院、上海民航職業(yè)技術(shù)學(xué)院、廣州民航職業(yè)技術(shù)學(xué)院。
| 序號 | 學(xué)校名稱 | 主管部門 | 所在地 | 層次 | 備注 |
| 1 | 中國民航大學(xué) | 交通運輸部（中國民用航空局） | 天津 | 本科 | 公辦 |
| 2 | 中國民用航空飛行學(xué)院 | 交通運輸部（中國民用航空局） | 四川德陽 | 本科 | 公辦 |
| 3 | 上海民航職業(yè)技術(shù)學(xué)院 | 交通運輸部（中國民用航空局） | 上海 | 專科 | 公辦 |
| 4 | 廣州民航職業(yè)技術(shù)學(xué)院 | 交通運輸部（中國民用航空局） | 廣東廣州 | ?？?/td> | 公辦 |
中國民航大學(xué)簡介：
中國民航大學(xué)前身是1951年9月成立的軍委民航局第二民用航空學(xué)校，1956年更名為中國人民解放軍第十四航校，1958年更名為中國民用航空高級航空學(xué)校，1963年重組為中國民用航空機械?？茖W(xué)校，1977年更名為中國民用航空?？茖W(xué)校，1981年更名為中國民用航空學(xué)院，2006年5月30日，更名為中國民航大學(xué)。
中國民用航空飛行學(xué)院簡介：
中國民用航空飛行學(xué)院簡稱中飛院（CAFUC），位于四川省廣漢市，是中央部屬高校，由中國民用航空局直屬，入選聯(lián)合國重點推廣的“MPL”課程試點單位、四川省“雙一流”建設(shè)計劃。是全球辦學(xué)規(guī)模最大的飛行培訓(xùn)機構(gòu)，是世界上規(guī)模最大的以飛行訓(xùn)練為主的學(xué)校，建校以來，中飛院已為中國民航培養(yǎng)了70%的飛行員、80%的機長、90%的功勛飛行員和100%的特級飛行員，被譽為中國民航飛行員的“搖籃”、中國民航管理干部的“黃埔”。
前身是創(chuàng)建于1956年的中國民用航空局航空學(xué)校，同年9月，更名為中國人民解放軍第十四航空學(xué)校，后又以中國民用航空高級航校、中國民用航空飛行?？茖W(xué)校為校名。1987年11月，升格為本科院校，更名為中國民用航空飛行學(xué)院。