內蒙古共有13所二本批次招生的大學參與了內蒙古二本大學排名理科，其中排名第一的是內蒙古醫(yī)科大學，排名第二的是內蒙古工業(yè)大學，排名第三的是內蒙古科技大學。
以下是內蒙古二本大學排名理科具體榜單，根據歷年理科二本錄取平均分排名理科，包含部分專業(yè)在一本招生的二本大學。
| 2018內蒙古二本大學排名理科 | 學校名稱 | 所在地 | 錄取批次 | 平均分 |
| 1 | 內蒙古醫(yī)科大學 | 內蒙古 | 本科二批 | 444 |
| 2 | 內蒙古工業(yè)大學 | 內蒙古 | 本科二批 | 443 |
| 3 | 內蒙古科技大學 | 內蒙古 | 本科二批 | 436 |
| 4 | 內蒙古農業(yè)大學 | 內蒙古 | 本科二批 | 422 |
| 5 | 內蒙古師范大學 | 內蒙古 | 本科二批 | 408 |
| 6 | 赤峰學院 | 內蒙古 | 本科二批 | 396 |
| 7 | 集寧師范學院 | 內蒙古 | 本科二批 | 396 |
| 8 | 內蒙古民族大學 | 內蒙古 | 本科二批 | 395 |
| 9 | 呼倫貝爾學院 | 內蒙古 | 本科二批 | 383 |
| 10 | 河套學院 | 內蒙古 | 本科二批 | 380 |
| 11 | 鄂爾多斯應用技術學院 | 內蒙古 | 本科二批 | 365 |
| 12 | 內蒙古師范大學鴻德學院 | 內蒙古 | 本科二批 | 363 |
| 13 | 內蒙古大學創(chuàng)業(yè)學院 | 內蒙古 | 本科二批 | 362 |