有以下的區(qū)別
1.在我國(guó)現(xiàn)階段，本三學(xué)院就是民辦大學(xué)或獨(dú)立學(xué)院，錄取分?jǐn)?shù)比二本低很多，同時(shí)學(xué)費(fèi)是二本院校學(xué)費(fèi)的好幾倍，因?yàn)閲?guó)家不對(duì)本三學(xué)院撥款。換句話說(shuō)，本三學(xué)院就是花錢(qián)買(mǎi)文憑。
2.社會(huì)輿論仍然對(duì)本三學(xué)院有偏見(jiàn)，學(xué)生就業(yè)時(shí)，用人單位對(duì)本三學(xué)院的學(xué)生存在一定程度的歧視。有時(shí)候，雖然不在明面上，但是會(huì)存在各個(gè)環(huán)節(jié)。
3.不得不承認(rèn)，在生源素質(zhì)、學(xué)習(xí)氛圍等方面，本三學(xué)院學(xué)生與本二的差距不小，本三學(xué)院學(xué)風(fēng)普遍不正，吃喝玩樂(lè)的多，好好學(xué)習(xí)的少。
4.在升學(xué)（考研究生）方面，國(guó)家教育部明確規(guī)定，各招生單位必須一視同仁，在這個(gè)角度講，本三、本二、本一無(wú)區(qū)別！
并不一定代表學(xué)校的優(yōu)劣
本一、本二、本三或者一本、二本、三本，只代表本科高校招生錄取的先后順序，并不一定代表學(xué)校的優(yōu)劣；非常一般的院校，如果協(xié)調(diào)申請(qǐng)也可以本一錄取，變身一本學(xué)校；好大學(xué)如果缺乏必要的溝通協(xié)調(diào)，也會(huì)被放在本二錄取。大多數(shù)省區(qū)市屬高校在本省區(qū)市都是本一錄取，而到了外省區(qū)市卻被放在了本二錄取，就是這個(gè)原因。
因?yàn)楦咝Ｕ猩峙武浫Φ搅四承┤?、某些學(xué)校的玻璃心，紛紛提出異義要求平等，于是，現(xiàn)在很多省區(qū)市都將本三招生的學(xué)校合并到本二錄?。粡V東等省區(qū)市甚至直接取消錄取批次，本一、本二、本三全都為本科批次。
本三學(xué)費(fèi)比本二貴很多
本二本三從畢業(yè)證書(shū)上面沒(méi)有什么區(qū)別，都是本科，畢業(yè)證書(shū)上也沒(méi)有注明本二本三，只是對(duì)學(xué)生上學(xué)來(lái)說(shuō)最直觀的就是本三學(xué)費(fèi)比本二貴很多，本三一般都是民辦院校，本二是公辦院校，2017年開(kāi)始安徽省已經(jīng)將二本三本合并為第二批本科錄取。
小編總結(jié)
（1）本三院校大部分都是民辦院校，好多都是一些獨(dú)立院校，比如青島理工大學(xué)琴島學(xué)院等等這樣的學(xué)校，而本二院校大部分都是公辦的，當(dāng)然也不排除有一些是民辦院校，比如濱州學(xué)院等等這樣以學(xué)院命名的基本上都是二本院校，當(dāng)然不是全部的，好多醫(yī)學(xué)院是本一院校！
（2）師資力量有區(qū)別，不用多說(shuō)，本二的師資肯定要優(yōu)于本三院校，本二的高層次人才要多于本三院校！
（3）學(xué)費(fèi)不同，本二院校學(xué)費(fèi)很低，大部分專業(yè)學(xué)費(fèi)都在幾千塊錢(qián)左右，而本三院校學(xué)費(fèi)很貴，基本上都在一萬(wàn)以上，甚至更多！
（4）錄取分?jǐn)?shù)有區(qū)別，本二院校的錄取分?jǐn)?shù)要明顯高于本三院校，學(xué)生的質(zhì)量要比本三院校高很多，本三院校好多學(xué)生都是剛過(guò)本科線，分?jǐn)?shù)偏低一些！