為貫徹“以學(xué)生為本”的教育理念，學(xué)校除特殊類型招生外給予本科學(xué)生轉(zhuǎn)專業(yè)機(jī)會(huì)，新生入學(xué)一學(xué)年后可依照《甘肅中醫(yī)藥大學(xué)普通高等教育轉(zhuǎn)專業(yè)管理辦法》進(jìn)行申請(qǐng)。

學(xué)校堅(jiān)持以甘肅道地藥材，地方中醫(yī)藥文獻(xiàn)，西部常見病、疑難病的中醫(yī)藥防治，名老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)傳承等研究為重點(diǎn)，建有17個(gè)省部級(jí)重點(diǎn)學(xué)科，9個(gè)省醫(yī)療衛(wèi)生重點(diǎn)學(xué)科，19門省級(jí)精品課程，總面積約2200平方米的科研實(shí)驗(yàn)中心。有1個(gè)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，3個(gè)國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥科研三級(jí)實(shí)驗(yàn)室，4個(gè)甘肅省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，2個(gè)甘肅省高校省級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，2個(gè)甘肅省高校人文社科重點(diǎn)研究基地；“甘肅省中藥現(xiàn)代化工程技術(shù)研究中心”、“蘭州中藥現(xiàn)代化工程技術(shù)研究開發(fā)中心”，“西北中藏藥協(xié)同創(chuàng)新中心”為甘肅省首批“2011協(xié)同創(chuàng)新中心”。學(xué)校是全國第四次中藥普查甘肅省試點(diǎn)工作技術(shù)依托單位、國家基本藥物所需中藥材種子種苗繁育基地建設(shè)甘肅省牽頭指導(dǎo)單位，還先后承擔(dān)國家、省部級(jí)和其他科研課題2100余項(xiàng)，鑒定省級(jí)以上科技成果400余項(xiàng)，獲廳局級(jí)以上科技進(jìn)步獎(jiǎng)200余項(xiàng)。主編、撰寫出版各種學(xué)術(shù)著作400余部，在省級(jí)以上刊物發(fā)表科研論文6000余篇。主辦《甘肅中醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)》、《中醫(yī)兒科雜志》、《甘肅基層衛(wèi)生》三種學(xué)術(shù)期刊，其中《中醫(yī)兒科雜志》為中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)系列雜志。學(xué)校直屬附屬醫(yī)院擁有院內(nèi)制劑106個(gè)，取得了較好的社會(huì)效益和經(jīng)濟(jì)效益。

學(xué)校高度重視黨建和思想政治教育工作，積極開展豐富多彩的校園文化活動(dòng)、社會(huì)實(shí)踐活動(dòng)和公益服務(wù)活動(dòng)，推進(jìn)“大學(xué)生素質(zhì)拓展計(jì)劃”，先后被評(píng)為“全省高校思想政治教育工作先進(jìn)單位”、“全省高校統(tǒng)戰(zhàn)工作先進(jìn)單位”。校工會(huì)和附院工會(huì)被授予“全國教科文衛(wèi)體系統(tǒng)先進(jìn)工會(huì)組織”榮譽(yù)稱號(hào)。