上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院位于創(chuàng)新求索、文化薈萃、包容并蓄的黃浦腹地，紅墻映日、梧桐環(huán)繞。其前身是由圣約翰大學(xué)醫(yī)學(xué)院(1896-1952)、震旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院(1911-1952)、同德醫(yī)學(xué)院（1918-1952)于1952年全國高等學(xué)校院系調(diào)整時(shí)合并而成的上海第二醫(yī)學(xué)院，1985年更名為上海第二醫(yī)科大學(xué)。1997年學(xué)校通過了“211工程”立項(xiàng)。2005年7月，上海交通大學(xué)與上海第二醫(yī)科大學(xué)合并，成立了新的由教育部、上海市政府重點(diǎn)共建的上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院，進(jìn)入“985”高校行列。2010年11月，學(xué)院成為衛(wèi)生部與教育部合作共建的第一批十個(gè)重點(diǎn)高校中的一員。
醫(yī)學(xué)院堅(jiān)決貫徹“人才強(qiáng)院”的主戰(zhàn)略，切實(shí)加強(qiáng)高層次人才隊(duì)伍建設(shè)，大師云集、人才薈萃。學(xué)院現(xiàn)有教職醫(yī)務(wù)員工25255名，專任教師640名，在職高級職稱2632人，博士生導(dǎo)師669人，碩士生導(dǎo)師1173人。其中包括中國科學(xué)院院士2人，中國工程院院士13人，歐洲科學(xué)院外籍院士2人，美國科學(xué)院外籍院士1人，法國科學(xué)院外籍院士2人，美國醫(yī)學(xué)科學(xué)院外籍院士2人，英國皇家內(nèi)科醫(yī)師學(xué)院院士1人，法國國家醫(yī)學(xué)科學(xué)院院士2人，發(fā)展中國家科學(xué)院院士2人，國際牙醫(yī)學(xué)院院士1人，中央“”9人，中央“青年”15人，國家“973”項(xiàng)目首席科學(xué)家17人次，教育部“長江學(xué)者特聘教授/講座教授”25人，國家杰出青年基金獲得者28人。
醫(yī)學(xué)院持續(xù)推動教育教學(xué)改革，不斷加強(qiáng)以基地建設(shè)與臨床優(yōu)勢為依托，以轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)理念為內(nèi)涵的“卓越醫(yī)學(xué)教育體系”建設(shè)。
醫(yī)學(xué)院包含23個(gè)學(xué)院（系），13所附屬醫(yī)院。覆蓋生物學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)等8個(gè)一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)、4個(gè)一級學(xué)科博士后流動站。有臨床醫(yī)學(xué)八年制（授予博士學(xué)位）、臨床醫(yī)學(xué)八年制（口腔醫(yī)學(xué)方向，授予博士學(xué)位）和7個(gè)本科專業(yè)（臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、生物醫(yī)學(xué)科學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)、護(hù)理學(xué)、營養(yǎng)學(xué)）。其中，臨床醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)、護(hù)理學(xué)為國家特色專業(yè)；臨床醫(yī)學(xué)八年制（法文班）、臨床醫(yī)學(xué)八年制（4+4碩博班）、臨床醫(yī)學(xué)五年制（兒科學(xué)方向）、臨床醫(yī)學(xué)五年制（英語班）是學(xué)院的特色班級。目前學(xué)院有在校生7486名，其中本科及長學(xué)制學(xué)生2655名，研究生4566名，留學(xué)生265名。