北京大學(xué)醫(yī)學(xué)教育開始于1912年，建校后先后稱為國立北京醫(yī)科專門學(xué)校、北京大學(xué)醫(yī)學(xué)院、北京醫(yī)學(xué)院、北京醫(yī)科大學(xué)。2000年與北京大學(xué)合并成為新的北京大學(xué)后，改稱北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部。
北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部在長達(dá)近一個(gè)世紀(jì)的辦學(xué)實(shí)踐中，逐漸形成了“勤奮、嚴(yán)謹(jǐn)、求實(shí)、創(chuàng)新”的學(xué)風(fēng)和“堅(jiān)定正確的政治方向，嚴(yán)謹(jǐn)求實(shí)的治學(xué)態(tài)度，熱忱獻(xiàn)身的服務(wù)精神”的校風(fēng)。
北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部師資雄厚，專業(yè)技術(shù)人員近萬人，其中高級職稱人員近六千人，兩院院士11名，長江學(xué)者74名，國家有突出貢獻(xiàn)專家16位。在校生人數(shù)一萬余人，其中研究生和本科生比例將近1:1。北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部現(xiàn)有12個(gè)一級學(xué)科博士、碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，50個(gè)二級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)和59個(gè)二級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，6個(gè)博士后流動(dòng)站。北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部以培養(yǎng)本科生、研究生為主體，同時(shí)又是國家繼續(xù)教育的培訓(xùn)基地。醫(yī)學(xué)部接收來自港澳臺地區(qū)學(xué)生、海外華僑學(xué)生和外國留學(xué)生到校學(xué)習(xí)。
北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、藥學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、公共教學(xué)部、第一臨床醫(yī)學(xué)院(北大醫(yī)院)、第二臨床醫(yī)學(xué)院(人民醫(yī)院)、第三臨床醫(yī)學(xué)院(北醫(yī)三院)、口腔醫(yī)學(xué)院、臨床腫瘤學(xué)院(腫瘤醫(yī)院)、精神衛(wèi)生研究所(北醫(yī)六院)、北京大學(xué)深圳醫(yī)院、北京大學(xué)首鋼醫(yī)院、醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)教育學(xué)院。另外，北京積水潭醫(yī)院、北京醫(yī)院、中日友好醫(yī)院、北京世紀(jì)壇醫(yī)院、中國航天中心醫(yī)院、回龍觀醫(yī)院、中國民用航空總醫(yī)院、首都兒科研究所、北京地壇醫(yī)院、中國人民解放軍302、306醫(yī)院、京煤集團(tuán)總醫(yī)院、北京仁和醫(yī)院也是醫(yī)學(xué)部的臨床醫(yī)學(xué)院或教學(xué)醫(yī)院。醫(yī)學(xué)部內(nèi)擁有教學(xué)樓、實(shí)驗(yàn)樓、圖書館、藥學(xué)樓、公共衛(wèi)生樓、醫(yī)藥分析中心、信息中心、電化教育中心、實(shí)驗(yàn)動(dòng)物部、檔案館、出版社、體育館等裝備精良的教學(xué)、科研設(shè)施。
北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部學(xué)科齊全。截至2007年，醫(yī)學(xué)部評估通過的重點(diǎn)學(xué)科包括生理學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、免疫學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)、內(nèi)科學(xué)(心血管病)、內(nèi)科學(xué)(血液病)、內(nèi)科學(xué)(腎病)、兒科學(xué)、精神病與精神衛(wèi)生學(xué)、皮膚病與性病學(xué)、外科學(xué)(骨外)、外科學(xué)(泌尿外)、婦產(chǎn)科學(xué)、眼科學(xué)、腫瘤學(xué)、運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)、口腔臨床醫(yī)學(xué)、口腔基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)、藥物化學(xué)、生藥學(xué)、藥理學(xué)等24個(gè)。
醫(yī)學(xué)部有1個(gè)國家級重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，11個(gè)省(部)級重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。在全國醫(yī)學(xué)院校中連續(xù)十余年獲國家自然科學(xué)基金第一名，完成科研課題和所獲各類科研基金以及在SCI及國內(nèi)刊物上發(fā)表論文數(shù)量均名列全國醫(yī)學(xué)院校首位。北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部與世界衛(wèi)生組織(WHO)、聯(lián)合國兒童基金會(huì)(UNICEF)、美國疾病控制中心、美國中華醫(yī)學(xué)基金會(huì)(CMB)等國際組織保持著良好的合作關(guān)系，并與十幾個(gè)國家和地區(qū)的20多所大學(xué)建立了良好的校際交流關(guān)系，先后聘請了70位世界著名學(xué)者為客座教授、名譽(yù)教授，其中3位是諾貝爾獎(jiǎng)獲得者。