1、專攻方向不同：

學(xué)術(shù)型碩士平時的主要工作就是研究課題、做實驗、發(fā)論文，在學(xué)術(shù)水平上比較擅長；而專業(yè)型碩士主要工作是在醫(yī)院里面進(jìn)行三年的規(guī)范化培訓(xùn)，跟隨導(dǎo)師完成一些臨床上的工作。

2、畢業(yè)有無規(guī)培證不同

這也是學(xué)術(shù)型碩士和專業(yè)型碩士最大的區(qū)別。專業(yè)型碩士由于是偏向臨床的，因此在研究生三年期間和規(guī)范化培訓(xùn)是同步進(jìn)行的。也就是說專業(yè)型碩士畢業(yè)后即可拿到學(xué)位證書、學(xué)歷證書和規(guī)范化培訓(xùn)證書。

而學(xué)術(shù)型碩士在研究生三年期間是無法拿到規(guī)培證書的，在畢業(yè)后如果需要進(jìn)入醫(yī)院崗位工作還需要規(guī)培三年拿到規(guī)培證才可以。

3、研究生類型不同：

醫(yī)學(xué)考研考學(xué)校的屬于學(xué)術(shù)型碩士，而考研考醫(yī)院的屬于專業(yè)型碩士，兩者類型不同。

4、報考專業(yè)原則：

(一)考生須按照與本科畢業(yè)專業(yè)相關(guān)或相近專業(yè)進(jìn)行報考；

(二) 部分專業(yè)報考要求：

1、醫(yī)學(xué)臨床（學(xué)術(shù)型）各專業(yè)只接受本科為醫(yī)學(xué)專業(yè)的學(xué)生報考。

2、臨床醫(yī)學(xué)及口腔醫(yī)學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位報考要求如下：

臨床醫(yī)學(xué)（除精神病與精神衛(wèi)生學(xué)、影像醫(yī)學(xué)與核醫(yī)學(xué)、臨床檢驗診斷學(xué)、眼科學(xué)和麻醉學(xué)以外各專業(yè)）只接收全日制本科為五年及以上學(xué)制西醫(yī)臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)的考生報考。

參考資料來源：百度百科—醫(yī)學(xué)專業(yè)碩士

參考資料來源：百度百科—學(xué)術(shù)型碩士